summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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2022-12-21gnu: pbbam: Use htslib 1.14.Ricardo Wurmus
2022-12-21gnu: Add htslib-1.14.Ricardo Wurmus
2022-12-18gnu: python-scanpy: Use pyproject-build-system.Ricardo Wurmus
2022-12-18gnu: python-multivelo: Simplify with pyproject-build-system.Ricardo Wurmus
2022-12-14gnu: bedtools-2.18: Use gexp.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: bedops: Update to 2.4.41.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: tophat: Remove trailing #T from build phases and snippet.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: python-bx-python: Update to 0.9.0.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: bioawk: Use gexp.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: blasr-libcpp: Remove trailing #T from build phases.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: pbbam: Drop input labels.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: pbbam: Update to 2.1.0.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: pbcopper: Update to 2.0.0.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: bedtools: Remove unnecessary quasiquotation.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: bamutils: Update to 1.0.15.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: bamtools: Update to 2.5.2.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: aragorn: Update to 1.2.41.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: cnvkit: Update to 0.9.9.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: seqmagick: Update to 0.8.4.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: python-cgatcore: Update to 0.6.14.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: python-dna-features-viewer: Update to 3.1.1.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: python-hicexplorer: Update to 3.7.2.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: python-pygenometracks: Update to 3.5.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: python-hicmatrix: Update to 16.Ricardo Wurmus
2022-12-13gnu: python-biopython: Update to 1.80.Ricardo Wurmus
2022-12-12gnu: bioperl-minimal: Remove trailing #T from build phase.Ricardo Wurmus
2022-12-02gnu: python-biom-format: Update to 2.1.12.Ricardo Wurmus
2022-12-02gnu: Add python-scikit-bio.Ricardo Wurmus
2022-12-02gnu: python-pairtools: Update to 1.0.2.Ricardo Wurmus
2022-12-02gnu: python-pairtools: Run tests conditionally.Ricardo Wurmus
2022-12-02gnu: python-pybedtools: Use pyproject-build-system.Ricardo Wurmus
2022-12-02gnu: python-htsget: Update to 0.2.6.Ricardo Wurmus
2022-12-02gnu: python-cellbender: Update to 0.2.2.Ricardo Wurmus
2022-12-02gnu: Add python-fanc.Ricardo Wurmus
2022-12-02gnu: Add python-genomic-regions.Ricardo Wurmus
2022-11-25gnu: Add r-btools.Navid Afkhami
2022-11-17gnu: r-circus: Update to 0.1.7.Ricardo Wurmus
2022-11-15gnu: Add r-disgenet2r.Ricardo Wurmus
2022-11-09gnu: Add r-pando.Mădălin Ionel Patrașcu
2022-11-04gnu: Add python-cooltools.Mădălin Ionel Patrașcu
2022-11-04gnu: Add python-bioframe.Mădălin Ionel Patrașcu
2022-11-04gnu: r-dyngen: Update to 1.0.5.Ricardo Wurmus
2022-10-31gnu: Fix various lint issues in synopsis and descriptions.Vagrant Cascadian
2022-10-28gnu: flair: Update to 1.6.4.Ricardo Wurmus
2022-10-28gnu: flair: Set R_HOME.Ricardo Wurmus
2022-10-28gnu: flair: Add missing R package.Ricardo Wurmus
2022-10-27gnu: flair: Add missing R packages.Ricardo Wurmus
2022-10-27gnu: Add python-multivelo.Mădălin Ionel Patrașcu
2022-10-27gnu: Add r-seuratwrappers.Hong.Li@mdc-berlin.de
2022-10-24gnu: Various typo fixes.Vagrant Cascadian
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