summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2015-08-29gnu: Use 'install-file' instead of 'mkdir-p' and 'copy-file' in obvious cases.Ludovic Courtès
2015-08-26gnu: Add BioPerl.Ricardo Wurmus
2015-08-14gnu: shogun: Move package to machine-learning.scm.Ricardo Wurmus
2015-07-25gnu: bedtools: Add patch to fix compilation on 32 bit systems.Ben Woodcroft
2015-07-25gnu: bedtools: Update to 2.24.0.Ben Woodcroft
2015-07-21gnu: Add aragorn.Ben Woodcroft
2015-07-19gnu: metabat: Minor tweaks.Mark H Weaver
2015-07-19gnu: Add metabat.Ben Woodcroft
2015-07-09gnu: preseq: Move "use-samtools-headers" phase.Ricardo Wurmus
2015-07-08gnu: Add preseq.Ricardo Wurmus
2015-07-08gnu: samtools: Install headers.Ricardo Wurmus
2015-07-07gnu: samtools: Update to 1.2.Ricardo Wurmus
2015-07-05gnu: Add prodigal.Ben Woodcroft
2015-07-04gnu: shogun: Build with install RPATH.Ricardo Wurmus
2015-07-02gnu: Add WarpedLMM.Ricardo Wurmus
2015-06-29gnu: Add Blast+.Ricardo Wurmus
2015-06-29gnu: Add plink.Ricardo Wurmus
2015-06-24gnu: Add hmmer.Ben Woodcroft
2015-06-23gnu: star: Update to 2.4.2a.Ricardo Wurmus
2015-06-23gnu: miso: Install executables.Ricardo Wurmus
2015-06-23gnu: Add idr.Ricardo Wurmus
2015-06-21gnu: Add fasttree.Ben Woodcroft
2015-06-17gnu: Add diamond.Ben Woodcroft
2015-06-17gnu: miso: Use HTTPS URL.Ricardo Wurmus
2015-06-17gnu: bedops: Update to 2.4.14.Ricardo Wurmus
2015-06-15gnu: orfm: Update to 0.4.1.Ricardo Wurmus
2015-06-12gnu: Add OrfM.Ben Woodcroft
2015-06-12gnu: Add Couger.Ricardo Wurmus
2015-06-12gnu: ngs-sdk: Update to version 1.1.1.Ricardo Wurmus
2015-06-02gnu: Add HTSlib.Ricardo Wurmus
2015-06-02gnu: ncbi-vdb: Use "i386" instead of "i686" in directory name.Ricardo Wurmus
2015-05-27gnu: Add edirect.Ricardo Wurmus
2015-05-27gnu: shogun: Remove non-free source files.Ricardo Wurmus
2015-05-22gnu: Add rsem.Ricardo Wurmus
2015-05-05gnu: vcftools: Remove "-m64" from CFLAGS.Ricardo Wurmus
2015-05-04gnu: bamtools: Set rpath via LDFLAGS.Ricardo Wurmus
2015-05-04gnu: Add samtools-0.1.19.Ricardo Wurmus
2015-05-04gnu: samtools: Install libbam.a library.Ricardo Wurmus
2015-05-04gnu: samtools: Remove patch-makefile-curses phase.Ricardo Wurmus
2015-04-27gnu: flexbar: Enable tests.Ricardo Wurmus
2015-04-21gnu: Add eXpress.Ricardo Wurmus
2015-04-21gnu: Add bamtools.Ricardo Wurmus
2015-04-21gnu: Add subread.Ricardo Wurmus
2015-04-20gnu: Add sra-tools.Ricardo Wurmus
2015-04-20gnu: Add NCBI VDB.Ricardo Wurmus
2015-04-20gnu: Add NGS Java bindings.Ricardo Wurmus
2015-04-20gnu: Add NGS SDK.Ricardo Wurmus
2015-04-20gnu: Add Biopython.Ricardo Wurmus
2015-04-16gnu: Add FASTX Toolkit.Ricardo Wurmus
2015-04-13gnu: rseqc: Update hash.Ricardo Wurmus
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