summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2017-04-06gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.10.3.Ricardo Wurmus
2017-04-06gnu: r-xvector: Update to 0.14.1.Ricardo Wurmus
2017-04-06gnu: r-bioccheck: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus
2017-04-05gnu: sra-tools: Fix glibc naming conflict.Ricardo Wurmus
2017-04-05gnu: sra-tools: Use "modify-phases" syntax.Ricardo Wurmus
2017-04-05gnu: diamond: Update to 0.8.37.Ben Woodcroft
2017-04-02gnu: Use HTTPS URLs for GitHub home-pages.Leo Famulari
2017-04-02gnu: khmer: Build with gcc-4.Ben Woodcroft
2017-03-30Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2017-03-30gnu: discrover: Add missing includes.Ricardo Wurmus
2017-03-30gnu: stringtie: Remove typedef conflict.Ricardo Wurmus
2017-03-28Replace (compose not PROC) with simpler idioms.Ludovic Courtès
2017-03-23gnu: star: Update to 2.5.3a.Ricardo Wurmus
2017-03-22gnu: python-pysam: Run tests in parallel.Ricardo Wurmus
2017-03-22gnu: python-pysam: Run tests before installation.Ricardo Wurmus
2017-03-22gnu: python-pysam: Update to 0.10.0.Ricardo Wurmus
2017-03-19gnu: Rename "guile-next" to "guile".Ludovic Courtès
2017-03-17gnu: r: Rename to r-minimal.Ricardo Wurmus
2017-03-17gnu: r: Do not build recommended packages.Ricardo Wurmus
2017-03-16gnu: Add r-seurat.Raoul Jean Pierre Bonnal
2017-03-16gnu: sra-tools: Update to 2.8.2-1.Ricardo Wurmus
2017-03-16gnu: ncbi-vdb: Install configuration files.Ricardo Wurmus
2017-03-16gnu: ncbi-vdb: Override search path for java-ngs.Ricardo Wurmus
2017-03-16gnu: ncbi-vdb: Use modify-phases syntax.Ricardo Wurmus
2017-03-16gnu: ncbi-vdb: Update to 2.8.2.Ricardo Wurmus
2017-03-16gnu: ngs-sdk: Update to 1.3.0.Ricardo Wurmus
2017-03-15gnu: Use INSTALL-FILE where appropriate.Tobias Geerinckx-Rice
2017-03-15gnu: samtools: End installation phases with truth.Tobias Geerinckx-Rice
2017-03-11gnu: vsearch: Update to 2.4.2.Ben Woodcroft
2017-03-11gnu: Add r-ape.Raoul Jean Pierre Bonnal
2017-03-10gnu: hmmer: Build reproducibly.Ben J. Woodcroft
2017-03-10gnu: Add sambamba.Ricardo Wurmus
2017-03-03Merge branch 'python-tests'Marius Bakke
2017-03-02gnu: diamond: Update to 0.8.36.Ben Woodcroft
2017-02-28gnu: bamtools: Update to 2.4.1.Ricardo Wurmus
2017-02-27gnu: ribodiff: Fix test failure.Marius Bakke
2017-02-24gnu: python-dendropy: Fix failing tests.Ricardo Wurmus
2017-02-13Merge branch 'master' into python-testsMarius Bakke
2017-02-09gnu: vsearch: Update to 2.4.0.Ben Woodcroft
2017-02-01gnu: r-edger: Add r-statmod to inputs.Ricardo Wurmus
2017-02-01download: url-fetch/tarball: Make ‘name’ truly optional.Tobias Geerinckx-Rice
2017-01-31gnu: Add r-rhdf5.Raoul Jean Pierre Bonnal
2017-01-31gnu: Add r-tximport.Raoul Jean Pierre Bonnal
2017-01-30gnu: Add r-bsgenome-hsapiens-1000genomes-hs37d5.Roel Janssen
2017-01-21gnu: r-vegan: Update to 2.4-2.Ben Woodcroft
2017-01-21gnu: diamond: Update to 0.8.34.Ben Woodcroft
2017-01-20gnu: r-msnid: Expand abbreviation in description.Ricardo Wurmus
2017-01-20gnu: r-msnbase: Expand abbreviation in description.Ricardo Wurmus
2017-01-18gnu: multiqc: Add python-nose to inputs.Ricardo Wurmus
2017-01-17gnu: Add r-msnid.Ricardo Wurmus
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