summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2021-11-17Merge branch 'master' into core-updates-frozenLudovic Courtès
2021-11-16gnu: pplacer: Fix build.Julien Lepiller
2021-11-15gnu: python-scanpy: Run tests conditionally.Ricardo Wurmus
2021-11-11gnu: ciri-long: Move Cython to native inputs.Ricardo Wurmus
2021-11-11gnu: ciri-long: Fix reference to ccs.Ricardo Wurmus
2021-11-11gnu: Add circtools.Ricardo Wurmus
2021-11-11gnu: Add bioparser.Ricardo Wurmus
2021-11-11gnu: Add biosoup.Ricardo Wurmus
2021-11-08Merge remote-tracking branch 'origin/master' into core-updates-frozenEfraim Flashner
2021-11-03gnu: bedtools-2.18: Fix build with newer toolchain.Ricardo Wurmus
2021-10-31Merge remote-tracking branch 'origin/master' into core-updates-frozenEfraim Flashner
2021-10-24gnu: sailfish: Use TBB 2020.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: sailfish: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: sailfish: Do not attempt to unpack a directory.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: jellyfish: Remove Ruby bindings.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: cutadapt: Regenerate Cython files.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: python-dnaio: Update to 0.6.0.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: macs: Fix build by setting HOME.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: methyldackel: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: methyldackel: Pass -fcommon to compiler.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: flexbar: Use TBB 2020.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: flexbar: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: bwa: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: bwa: Pass -fcommon to compiler.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: bowtie1: Use TBB 2020.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: bowtie: Replace invalid characters.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: bowtie: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: bowtie: Use TBB 2020.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: Add r-umi4cpackage.Ricardo Wurmus
2021-10-24gnu: tbb-for-salmon: Rename.Ricardo Wurmus
2021-10-22gnu: Add qtltools.Ricardo Wurmus
2021-10-21gnu: Add gdc-client.Ricardo Wurmus
2021-10-21gnu: Add r-shaman.Ricardo Wurmus
2021-10-21gnu: Add r-misha.Ricardo Wurmus
2021-10-21gnu: Add ciri-long.Ricardo Wurmus
2021-10-21gnu: python-biopython: Update to 1.76.Ricardo Wurmus
2021-10-21gnu: instrain: Update to 1.5.4.Ricardo Wurmus
2021-10-21gnu: Add python-bwapy.Ricardo Wurmus
2021-10-21gnu: Add python-pyspoa.Ricardo Wurmus
2021-10-19gnu: salmon: Use older version of TBB.Ricardo Wurmus
2021-10-12Merge remote-tracking branch 'origin/master' into core-updates-frozen.Mathieu Othacehe
2021-10-12gnu: clipper: Disable non-deterministic test.Felix Gruber
2021-10-08gnu: pigx-scrnaseq: Remove dependency on pandoc-citeproc.Lars-Dominik Braun
2021-10-08gnu: pigx-rnaseq: Remove dependency on pandoc-citeproc.Lars-Dominik Braun
2021-10-08gnu: pigx-chipseq: Remove dependency on pandoc-citeproc.Lars-Dominik Braun
2021-10-08gnu: pigx-sars-cov2-ww: Remove dependency on pandoc-citeproc.Lars-Dominik Braun
2021-10-08gnu: pigx-bsseq: Remove dependency on pandoc-citeproc.Lars-Dominik Braun
2021-10-08gnu: ngless: Fix build.Lars-Dominik Braun
2021-10-08gnu: Update Haskell ecosystem.Lars-Dominik Braun
2021-09-29gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.53.Ricardo Wurmus