summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2023-05-14gnu: blast+: Update to 2.14.0.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: jamm: Use G-expression.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: arriba: Use SEARCH-INPUT-FILE and -DIRECTORY.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: multichoose: Clean up.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: samblaster: Update to 0.1.26.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: samblaster: Simplify.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: methyldackel: Update to 0.6.1.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: methyldackel: Simplify arguments.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: phast: Simplify by using G-expression.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: ribotaper: Simplify with G-expression.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: sra-tools: Do link with libxml2.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: ncbi-vdb: Ensure that vdb-sqlite is installed.Ricardo Wurmus
2023-05-12gnu: Add python-mgatk.Mădălin Ionel Patrașcu
2023-05-08gnu: Add homer.Ricardo Wurmus
2023-05-05Revert "gnu: Add python-gimmemotifs."Ricardo Wurmus
2023-05-05gnu: Add python-gimmemotifs.Ricardo Wurmus
2023-05-05gnu: Add python-biofluff.Ricardo Wurmus
2023-05-05gnu: Add python-genomepy.Ricardo Wurmus
2023-05-05gnu: Add python-logomaker.Ricardo Wurmus
2023-05-05gnu: python-pyfaidx: Update to 0.7.2.1.Ricardo Wurmus
2023-05-04gnu: python-screed: Update to 1.1.2.Mădălin Ionel Patrașcu
2023-05-04gnu: Add python-goatools.Navid Afkhami
2023-05-03gnu: pigx-sars-cov-2: Update to 0.0.9.Ricardo Wurmus
2023-05-03gnu: Add fanc.Ricardo Wurmus
2023-04-29gnu: r-tictoc: Update to 1.2.Ricardo Wurmus
2023-04-27gnu: gdcm: Disable dependent tests.Ricardo Wurmus
2023-04-27gnu: freebayes: Update to 1.3.7.Ricardo Wurmus
2023-04-27gnu: vcflib: Use libwfa2.pc.Ricardo Wurmus
2023-04-27gnu: wfa2-lib: Install pkg-config file.Ricardo Wurmus
2023-04-27gnu: express: Adjust bamtools location.Ricardo Wurmus
2023-04-26gnu: python-dendropy: Fix build.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: cwltool: Use pyproject-build-system.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: python-schema-salad: Use pyproject-build-system.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: adapterremoval: Update to 2.3.3.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: bedtools-2.18: Fix build.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: hisat: Build with GCC 10.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: kallisto: Update to 0.48.0.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: bpp-core: Build with GCC 10.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: vcflib: Update to 1.0.9.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: tabixpp: Update to 1.1.2.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: Add wfa2-lib.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: lofreq: Set file timestamps to 1980s.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: lofreq: Drop input labels.Ricardo Wurmus
2023-04-25gnu: ivar: Update to 1.4.2.Ricardo Wurmus
2023-04-24gnu: multiqc: Update to 1.14.Ricardo Wurmus
2023-04-24gnu: macs: Patch version check for Python.Ricardo Wurmus
2023-04-24gnu: salmon: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus
2023-04-24gnu: Add htscodecs.Ricardo Wurmus
2023-04-22Merge remote-tracking branch 'origin/master' into core-updatesAndreas Enge
2023-04-21gnu: bppsuite: Update to 2.4.1.Mădălin Ionel Patrașcu