summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2016-04-26gnu: r-acsnminer: Update to 0.16.01.29.Ricardo Wurmus
2016-04-26gnu: r-qtl: Update to 1.39-5.Ricardo Wurmus
2016-04-26gnu: Add filevercmp.Roel Janssen
2016-04-24gnu: samtools: Update to 1.3.1.Ben Woodcroft
2016-04-19gnu: Rename Java packages to match new naming specification.Hartmut Goebel
2016-04-19gnu: python2-plastid: Propagate setuptools.Ricardo Wurmus
2016-04-19gnu: Add python-plastid.Ricardo Wurmus
2016-04-19gnu: Add python-twobitreader.Ricardo Wurmus
2016-04-14gnu: packages: Use 'search-patches' everywhere.Alex Kost
2016-04-11gnu: Add r-bsgenome-dmelanogaster-ucsc-dm3.Ricardo Wurmus
2016-04-11gnu: Add r-bsgenome-celegans-ucsc-ce6.Ricardo Wurmus
2016-04-11gnu: Add r-bsgenome-mmusculus-ucsc-mm9.Ricardo Wurmus
2016-04-11gnu: Add r-motifrg.Ricardo Wurmus
2016-04-11gnu: Add r-bsgenome-hsapiens-ucsc-hg19.Ricardo Wurmus
2016-04-11gnu: Add r-seqlogo.Ricardo Wurmus
2016-04-06gnu: Add r-zlibbioc.Roel Janssen
2016-04-06gnu: Add r-variantannotation.Roel Janssen
2016-04-05gnu: vcftools: Update to 0.1.14.Roel Janssen
2016-03-30gnu: python2-pbcore: Update to 1.2.8.Efraim Flashner
2016-03-30gnu: r-genomation: Update to 1.2.2.Ricardo Wurmus
2016-03-30gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.22.13.Ricardo Wurmus
2016-03-30gnu: r-rtracklayer: Update to 1.30.4.Ricardo Wurmus
2016-03-30gnu: r-genomicalignments: Update to 1.6.3.Ricardo Wurmus
2016-03-30gnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.0.2.Ricardo Wurmus
2016-03-30gnu: r-biostrings: Update to 2.38.4.Ricardo Wurmus
2016-03-30gnu: r-genomicranges: Update to 1.22.4.Ricardo Wurmus
2016-03-30gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.6.3.Ricardo Wurmus
2016-03-24gnu: Remove "r-repository" property.Ricardo Wurmus
2016-03-18gnu: r-dnacopy: Fix home page URL.Ludovic Courtès
2016-03-17gnu: bless: Remove bundled sources for sparsehash.Ricardo Wurmus
2016-03-17gnu: Add CD-HIT.Ricardo Wurmus
2016-03-16gnu: Add r-dnacopy.Roel Janssen
2016-03-16gnu: Add codingquarry.Rob Syme
2016-03-14gnu: htsjdk: Use ant-build-system.Ricardo Wurmus
2016-03-14gnu: Add pyicoteo.Ricardo Wurmus
2016-03-10gnu: Add bioawk.Roel Janssen
2016-03-03gnu: python-pysam: Move cython and setuptools to native inputs.Ricardo Wurmus
2016-03-03gnu: deeptools: Update to 2.1.1.Ricardo Wurmus
2016-03-03gnu: deeptools: Change "propagated-inputs" to "inputs".Ricardo Wurmus
2016-03-03gnu: Add python-pybigwig.Ricardo Wurmus
2016-03-03gnu: python-pysam: Update to 0.8.4.Ricardo Wurmus
2016-03-03gnu: python-pysam, python2-pysam: Move to bioinformatics.scm.Ricardo Wurmus
2016-03-01gnu: r-go-db: Bioconductor changed URL for data downloads.Pjotr Prins
2016-03-01gnu: r-iranges: Update to 2.4.8.Pjotr Prins
2016-03-01gnu: r-s4vectors: Update to 0.8.11.Pjotr Prins
2016-03-01gnu: Add PePr.Ricardo Wurmus
2016-03-01gnu: Add bwa-pssm.Ricardo Wurmus
2016-02-27gnu: Fix misplaced commas (unquote).Mark H Weaver
2016-02-25gnu: Add missing import in bioinformatics.scm.Ludovic Courtès
2016-02-25gnu: Add libBigWig.Ricardo Wurmus