summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2016-02-16gnu: htseq: Add PySam to inputs.Ricardo Wurmus
2016-02-16gnu: Add StringTie.Ricardo Wurmus
2016-02-16gnu: prodigal: Update to 2.6.3.Ben Woodcroft
2016-02-15gnu: r-annotationdbi: Update to 1.32.3.Ricardo Wurmus
2016-02-15gnu: vsearch: Update to 1.10.0.Ben Woodcroft
2016-02-12gnu: macs: Update to 2.1.0.20151222.Ricardo Wurmus
2016-02-12gnu: macs: Use "pypi-uri".Ricardo Wurmus
2016-02-02gnu: Update sortmerna to 2.1.Ben J. Woodcroft
2016-01-26gnu: sra-tools: Update to 2.5.7.Ben Woodcroft
2016-01-26gnu: ncbi-vdb: Update to 2.5.7.Ben Woodcroft
2016-01-26gnu: ngs-sdk: Update to 1.2.3.Ben Woodcroft
2016-01-25gnu: Add sortmerna.Ben Woodcroft
2016-01-23gnu: Add cufflinks.Ricardo Wurmus
2016-01-23gnu: Add TopHat.Ricardo Wurmus
2016-01-23gnu: star: Update to 2.5.1b.Ricardo Wurmus
2016-01-23gnu: star: Use "modify-phases" syntax.Ricardo Wurmus
2016-01-21gnu: r-qtl: Update to 1.38-4.Pjotr Prins
2016-01-16gnu: samtools-0.1: Adapt to changes in "samtools" variable.Ricardo Wurmus
2016-01-14gnu: r-go-db: Add missing input.Ricardo Wurmus
2016-01-14gnu: bowtie: Update to 2.2.6.Ricardo Wurmus
2016-01-14gnu: orfm: Update to 0.5.3.Ben Woodcroft
2016-01-13gnu: samtools: Update to 1.3.Ricardo Wurmus
2016-01-12gnu: Add fxtract.Ben Woodcroft
2016-01-11gnu: bedtools: Update to 2.25.0.Ben Woodcroft
2016-01-11gnu: bedtools: Use modify-phases.Ben Woodcroft
2016-01-08gnu: Add missing (gnu packages gcc) import.Mathieu Lirzin
2016-01-07gnu: Add genomation.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add seqPattern.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add impute.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add BSgenome.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add topGO.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add GO.db.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add GenomicFeatures.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add rtracklayer.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add GenomicAlignments.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add SummarizedExperiment.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add Rsamtools.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add Biostrings.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add BiocParallel.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add biomaRt.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add AnnotationDbi.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: Add Biobase.Ricardo Wurmus
2016-01-07gnu: edirect: Update to 3.50.Ricardo Wurmus
2016-01-06gnu: Add and use default IcedTea.Ricardo Wurmus
2016-01-06gnu: Add Jellyfish.Ricardo Wurmus
2015-12-29gnu: Add fraggenescan.Ben Woodcroft
2015-12-21gnu: Add GenomicRanges.Ricardo Wurmus
2015-12-21gnu: Add XVector.Ricardo Wurmus
2015-12-21gnu: Add GenomeInfoDb.Ricardo Wurmus
2015-12-21gnu: Add IRanges.Ricardo Wurmus
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