summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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2018-05-01gnu: Use HTTPS for www.boost.org.Tobias Geerinckx-Rice
2018-04-28gnu: roary: Update to 3.12.0.Roel Janssen
2018-04-28gnu: star: Update to 2.6.0a.Roel Janssen
2018-04-28gnu: multiqc: Update to 1.5.Roel Janssen
2018-04-28gnu: express: Link with shared protobuf library.Roel Janssen
2018-04-28gnu: bamtools: Update to 2.5.1.Roel Janssen
2018-04-28gnu: taxtastic: Update to 0.8.5.Roel Janssen
2018-04-27gnu: vsearch: Update to 2.8.0.Ben Woodcroft
2018-04-27gnu: diamond: Update to 0.9.21.Ben Woodcroft
2018-04-27gnu: bedops: Update to 2.4.33.Roel Janssen
2018-04-27gnu: samtools: Update to 1.8.Roel Janssen
2018-04-27gnu: bcftools: Update to 1.8.Roel Janssen
2018-04-27gnu: htslib: Update to 1.8.Roel Janssen
2018-04-22gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.15.Ricardo Wurmus
2018-04-21gnu: r-seurat: Update to 2.3.0.Ricardo Wurmus
2018-04-21gnu: r-scran: Update to 1.6.9.Ricardo Wurmus
2018-04-21gnu: r-hitc: Update to 1.22.1.Ricardo Wurmus
2018-04-21gnu: r-ldblock: Update to 1.8.1.Ricardo Wurmus
2018-04-21gnu: r-erma: Update to 0.10.1.Ricardo Wurmus
2018-04-21gnu: r-gprofiler: Update to 0.6.6.Ricardo Wurmus
2018-04-21gnu: r-ggbio: Update to 1.26.1.Ricardo Wurmus
2018-04-21gnu: r-genomicalignments: Update to 1.14.2.Ricardo Wurmus
2018-04-21gnu: r-dexseq: Update to 1.24.4.Ricardo Wurmus
2018-04-21gnu: r-vegan: Update to 2.5-1.Ricardo Wurmus
2018-04-06gnu: sambamba: Update to 0.6.7-10-g223fa20.Ricardo Wurmus
2018-04-06gnu: htslib-for-sambamba: Fix build.Ricardo Wurmus
2018-03-30gnu: Add delly.Roel Janssen
2018-03-30gnu: mash: Update to 2.0.Ben Woodcroft
2018-03-30gnu: mafft: Update to 7.394.Ben Woodcroft
2018-03-30gnu: diamond: Update to 0.9.19.Ben Woodcroft
2018-03-29gnu: r-mutationalpatterns: Update to 1.4.3.Roel Janssen
2018-03-29gnu: kaiju: Update to 1.6.2.Roel Janssen
2018-03-25gnu: r-annotate: Update to 1.56.2.Tobias Geerinckx-Rice
2018-03-22gnu: r-bookdown: Do not propagate ghc-pandoc.Ricardo Wurmus
2018-03-21gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.10.Ricardo Wurmus
2018-03-20gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.9.Ricardo Wurmus
2018-03-20gnu: pigx-bsseq: Update to 0.0.8.Ricardo Wurmus
2018-03-20gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.3.Ricardo Wurmus
2018-03-19gnu: pigx-bsseq: Update to 0.0.7.Ricardo Wurmus
2018-03-19gnu: bismark: Fix references to gunzip.Ricardo Wurmus
2018-03-19gnu: pigx-scrnaseq: Update to 0.0.3.Ricardo Wurmus
2018-03-19gnu: pigx: Update to 0.0.2.Ricardo Wurmus
2018-03-19gnu: r-rcas: Use ghc-pandoc-citeproc-with-pandoc-1.Ricardo Wurmus
2018-03-19gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.8.Ricardo Wurmus
2018-03-19gnu: pigx-scrnaseq: Use pandoc-1.Ricardo Wurmus
2018-03-19gnu: pigx-bsseq: Use pandoc-1.Ricardo Wurmus
2018-03-19gnu: pigx-chipseq: Use pandoc-1.Ricardo Wurmus
2018-03-19gnu: pigx-rnaseq: Use pandoc-1.Ricardo Wurmus
2018-03-16gnu: Add pigx.Ricardo Wurmus
2018-03-16gnu: pigx-rnaseq: Disable memory hungry test.Ricardo Wurmus