summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2016-03-17gnu: bless: Remove bundled sources for sparsehash.Ricardo Wurmus
2016-03-17gnu: Add CD-HIT.Ricardo Wurmus
2016-03-16gnu: Add r-dnacopy.Roel Janssen
2016-03-16gnu: Add codingquarry.Rob Syme
2016-03-14gnu: htsjdk: Use ant-build-system.Ricardo Wurmus
2016-03-14gnu: Add pyicoteo.Ricardo Wurmus
2016-03-10gnu: Add bioawk.Roel Janssen
2016-03-03gnu: python-pysam: Move cython and setuptools to native inputs.Ricardo Wurmus
2016-03-03gnu: deeptools: Update to 2.1.1.Ricardo Wurmus
2016-03-03gnu: deeptools: Change "propagated-inputs" to "inputs".Ricardo Wurmus
2016-03-03gnu: Add python-pybigwig.Ricardo Wurmus
2016-03-03gnu: python-pysam: Update to 0.8.4.Ricardo Wurmus
2016-03-03gnu: python-pysam, python2-pysam: Move to bioinformatics.scm.Ricardo Wurmus
2016-03-01gnu: r-go-db: Bioconductor changed URL for data downloads.Pjotr Prins
2016-03-01gnu: r-iranges: Update to 2.4.8.Pjotr Prins
2016-03-01gnu: r-s4vectors: Update to 0.8.11.Pjotr Prins
2016-03-01gnu: Add PePr.Ricardo Wurmus
2016-03-01gnu: Add bwa-pssm.Ricardo Wurmus
2016-02-27gnu: Fix misplaced commas (unquote).Mark H Weaver
2016-02-25gnu: Add missing import in bioinformatics.scm.Ludovic Courtès
2016-02-25gnu: Add libBigWig.Ricardo Wurmus
2016-02-24gnu: r-topgo: Add missing input.Ricardo Wurmus
2016-02-24gnu: Add r-graph.Ricardo Wurmus
2016-02-24gnu: Add r-org-mm-eg-db.Ricardo Wurmus
2016-02-24gnu: Add r-org-dm-eg-db.Ricardo Wurmus
2016-02-24gnu: Add r-org-ce-eg-db.Ricardo Wurmus
2016-02-24gnu: Add r-org-hs-eg-db.Ricardo Wurmus
2016-02-16gnu: htseq: Add PySam to inputs.Ricardo Wurmus
2016-02-16gnu: Add StringTie.Ricardo Wurmus
2016-02-16gnu: prodigal: Update to 2.6.3.Ben Woodcroft
2016-02-15gnu: r-annotationdbi: Update to 1.32.3.Ricardo Wurmus
2016-02-15gnu: vsearch: Update to 1.10.0.Ben Woodcroft
2016-02-12gnu: macs: Update to 2.1.0.20151222.Ricardo Wurmus
2016-02-12gnu: macs: Use "pypi-uri".Ricardo Wurmus
2016-02-02gnu: Update sortmerna to 2.1.Ben J. Woodcroft
2016-01-26gnu: sra-tools: Update to 2.5.7.Ben Woodcroft
2016-01-26gnu: ncbi-vdb: Update to 2.5.7.Ben Woodcroft
2016-01-26gnu: ngs-sdk: Update to 1.2.3.Ben Woodcroft
2016-01-25gnu: Add sortmerna.Ben Woodcroft
2016-01-23gnu: Add cufflinks.Ricardo Wurmus
2016-01-23gnu: Add TopHat.Ricardo Wurmus
2016-01-23gnu: star: Update to 2.5.1b.Ricardo Wurmus
2016-01-23gnu: star: Use "modify-phases" syntax.Ricardo Wurmus
2016-01-21gnu: r-qtl: Update to 1.38-4.Pjotr Prins
2016-01-16gnu: samtools-0.1: Adapt to changes in "samtools" variable.Ricardo Wurmus
2016-01-14gnu: r-go-db: Add missing input.Ricardo Wurmus
2016-01-14gnu: bowtie: Update to 2.2.6.Ricardo Wurmus
2016-01-14gnu: orfm: Update to 0.5.3.Ben Woodcroft
2016-01-13gnu: samtools: Update to 1.3.Ricardo Wurmus
2016-01-12gnu: Add fxtract.Ben Woodcroft
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