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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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2019-03-18gnu: Add blasr.Ricardo Wurmus
2019-03-18gnu: Add blasr-libcpp.Ricardo Wurmus
2019-03-18gnu: Add pbbam.Ricardo Wurmus
2019-03-15gnu: Add bwa-meth.Ricardo Wurmus
2019-03-13gnu: Add python-velocyto.Ricardo Wurmus
2019-03-13gnu: python-loompy: Update to 2.0.17.Ricardo Wurmus
2019-03-13gnu: Add tetoolkit.Ricardo Wurmus
2019-03-12gnu: r-qvalue: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: blast+: Update to 2.7.1.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-mzr: Update to 2.16.2.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-gviz: Update to 1.26.5.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-ensembldb: Update to 2.6.7.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-annotationhub: Update to 2.14.4.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-rhtslib: Update to 1.14.1.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.34.4.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-rtracklayer: Update to 1.42.2.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-rsamtools: Update to 1.34.1.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-biocparallel: Update to 1.16.6.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-variantannotation: Update to 1.28.11.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.18.2.Ricardo Wurmus
2019-03-08gnu: r-dexseq: Update to 1.28.2.Ricardo Wurmus
2019-03-07gnu: cd-hit: Support longer sequences.Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-org-mm-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-org-hs-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-org-dm-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-org-ce-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-txdb-mmusculus-ucsc-mm10-knowngene: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-bsgenome-dmelanogaster-ucsc-dm3: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-bsgenome-celegans-ucsc-ce10: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-bsgenome-celegans-ucsc-ce6: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-bsgenome-mmusculus-ucsc-mm10: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-bsgenome-mmusculus-ucsc-mm9: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-bsgenome-hsapiens-ucsc-hg19: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-bsgenome-hsapiens-1000genomes-hs37d5: Move to (gnu packages bioconduct...Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-txdb-hsapiens-ucsc-hg19-knowngene: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-geneplotter: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-copynumber: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: bismark: Update to 0.20.1.Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: Add r-scde.Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: Add bowtie1.Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: Add genrich.Ricardo Wurmus
2019-03-06gnu: r-dnacopy: Remove duplicate definition.Ricardo Wurmus
2019-03-02gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.31.Ricardo Wurmus
2019-03-01gnu: Add velvet.Ricardo Wurmus
2019-03-01gnu: discrover: Remove indirect TexLive dependencies.Ricardo Wurmus
2019-02-27gnu: flexbar: Fix reproducibility bug.Ricardo Wurmus
2019-02-25gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.21.Ricardo Wurmus
2019-02-25gnu: discrover: Replace "texlive" with a texlive-union.Ricardo Wurmus
2019-02-19gnu: pplacer: Remove the package, which is affected by a CVE on ocaml@4.01.Andreas Enge
2019-02-17gnu: Remove unneeded uses of python{,2}-minimal.Marius Bakke
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