summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2018-12-05gnu: mash: Use C++ 14.Christopher Baines
2018-12-04gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.5.Ricardo Wurmus
2018-11-24gnu: bless: Adjust to zlib static output.Marius Bakke
2018-11-24gnu: mosaik: Fix FTBFS from b90289dadc8ee15848ce911a2bdcd3ae8302d58c.Marius Bakke
2018-11-23gnu: pigx-scrnaseq: Use latest snakemake.Ricardo Wurmus
2018-11-23gnu: pigx-bsseq: Use latest snakemake.Ricardo Wurmus
2018-11-23gnu: pigx-chipseq: Use latest snakemake.Ricardo Wurmus
2018-11-23gnu: python-loompy: Remove python-typing.Ricardo Wurmus
2018-11-20Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2018-11-19gnu: r-ensembldb: Update to 2.6.2.Roel Janssen
2018-11-19gnu: r-msnbase: Update to 2.8.1.Roel Janssen
2018-11-19gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.18.1.Roel Janssen
2018-11-15gnu: Add nanopolish.pimi
2018-11-15gnu: sambamba: Update to 0.6.8.Roel Janssen
2018-11-14gnu: bioinformatics: Return #t from all phases and snippets.Mark H Weaver
2018-11-14gnu: Add jamm.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-txdb-mmusculus-ucsc-mm10-knowngene: Update to 3.4.4.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-org-mm-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-org-dm-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-org-ce-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-org-hs-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-genomationdata: Update to 1.14.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-go-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus
2018-11-13gnu: r-genomeinfodbdata: Update to 1.2.0.Ricardo Wurmus
2018-11-11gnu: r-s4vectors: Update to 0.20.1.Ricardo Wurmus
2018-11-09gnu: r-ensembldb: Update to 2.6.1.Ricardo Wurmus
2018-11-09gnu: r-biostrings: Update to 2.50.1.Ricardo Wurmus
2018-11-09gnu: r-biocviews: Update to 1.50.5.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: pplacer-scripts: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: roary: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: seek: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: sailfish: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: vsearch: Update to 2.9.1.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: sra-tools: Update to 2.9.3.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: plink-ng: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: ncbi-vdb: Update to 2.9.3.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: ngs-sdk: Update to 2.9.3.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: ngs-sdk: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: emboss: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: taxtastic: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: sra-tools: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: muscle: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: newick-utils: Remove custom autoconf phase.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: mash: Remove custom autoconf phase.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: vsearch: Remove custom autogen phase.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: java-picard-1.113: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: fraggenescan: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: sailfish: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: ngs-sdk: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus
2018-11-08gnu: ncbi-vdb: Use INVOKE and end phases on #T.Ricardo Wurmus