summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2019-08-13Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2019-08-09gnu: freebayes: Simplify and enable tests.Ricardo Wurmus
2019-08-09gnu: freebayes: Move bamtools to inputs.Ricardo Wurmus
2019-08-09gnu: Add freebayes.Pierre Neidhardt
2019-08-09gnu: Add vcflib.Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: r-hdf5array: Update to 1.12.2.Ricardo Wurmus
2019-08-08gnu: r-biocparallel: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus
2019-08-08Revert "gnu: Add vcflib."Efraim Flashner
2019-08-08Revert "gnu: Add freebayes."Efraim Flashner
2019-08-08gnu: Add freebayes.Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add vcflib.Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add fastahack.Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add fsom.Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add multichoose.Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add smithwaterman.Pierre Neidhardt
2019-08-08gnu: Add tabixpp.Pierre Neidhardt
2019-08-07gnu: Remove ghc-parsec, ghc-stm, ghc-text, ghc-xhtml.Robert Vollmert
2019-08-06gnu: r-msnid: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-rcas: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.36.4.Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-rtracklayer: Update to 1.44.2.Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.14.1.Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-biomart: Update to 2.40.3.Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-limma: Update to 3.40.6.Ricardo Wurmus
2019-08-06gnu: r-edger: Update to 3.26.6.Ricardo Wurmus
2019-08-05gnu: khmer: Make gzip timestamps writable.Brian Leung
2019-07-31gnu: prank: Update to 170427.Marius Bakke
2019-07-31Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2019-07-25gnu: Explicitly refer to 'guile-json-1' when needed.Ludovic Courtès
2019-07-22Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2019-07-22gnu: htslib: Propagate zlib.Ricardo Wurmus
2019-07-18gnu: bpp: Use the default GCC.Marius Bakke
2019-07-17Merge branch 'master' into core-updatesLudovic Courtès
2019-07-17gnu: nanopolish: Fix build with GCC 7.Marius Bakke
2019-07-15gnu: salmon: Fix build with GCC 7.Marius Bakke
2019-07-15gnu: Add python-ont-fast5-api.Ricardo Wurmus
2019-07-14gnu: Adjust uses of C{,PLUS}_INCLUDE_PATH for GCC 7.Marius Bakke
2019-07-13gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.10.Ricardo Wurmus
2019-07-12Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2019-07-09gnu: r-biocinstaller: Remove entirely.Tobias Geerinckx-Rice
2019-07-08gnu: Remove r-biocinstaller.Tobias Geerinckx-Rice
2019-07-08gnu: r-xbioc: Update to 0.1.16-1.6ff0670.Tobias Geerinckx-Rice
2019-07-05gnu: nanopolish: Update to 0.11.1-1.6331dc4.Ricardo Wurmus
2019-07-04gnu: Remove ghc-parsec, ghc-stm, ghc-text, ghc-xhtml.Robert Vollmert
2019-07-04gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.8.Ricardo Wurmus
2019-06-29gnu: r-phangorn: Update to 2.5.5.Ricardo Wurmus
2019-06-29gnu: r-tximport: Update to 1.12.3.Ricardo Wurmus
2019-06-29gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.36.3.Ricardo Wurmus
2019-06-29gnu: r-genomicalignments: Update to 1.20.1.Ricardo Wurmus
2019-06-29gnu: r-biomart: Update to 2.40.1.Ricardo Wurmus
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