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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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2020-03-18Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-03-14Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-03-17gnu: pigx-scrnaseq: Update to 1.1.4.Ricardo Wurmus
2020-03-16gnu: star: Update to 2.7.3a.Ricardo Wurmus
2020-03-13gnu: salmon: Adjust for C_INCLUDE_PATH changes.Marius Bakke
2020-03-12gnu: edirect: Update to 13.3.20200128.Efraim Flashner
2020-03-12gnu: r-qtl: Update to 1.46-2.Ricardo Wurmus
2020-03-11gnu: python-pybedtools: Update to 0.8.1.Efraim Flashner
2020-03-11gnu: python-pyfaidx: Update to 0.5.8.Efraim Flashner
2020-03-11gnu: Add python2-pyfaidx.Efraim Flashner
2020-03-10gnu: java-forester-1.005: Update source URI.Björn Höfling
2020-03-09gnu: Fix build of python-velocyto.Roel Janssen
2020-03-08gnu: ngless: Update to 1.1.0.Ricardo Wurmus
2020-03-08gnu: taxtastic: Update to 0.8.11.Ricardo Wurmus
2020-03-07gnu: r-methylkit: Add r-knitr.Ricardo Wurmus
2020-03-07gnu: r-vsn: Add r-knitr.Ricardo Wurmus
2020-03-06gnu: python-scanpy: Update to 1.4.5.1.Ricardo Wurmus
2020-03-03gnu: gess: Use WRAP-SCRIPT.Ricardo Wurmus
2020-03-03gnu: gess: Override PYTHONPATH.Ricardo Wurmus
2020-03-02gnu: r-seqminer: Update to 8.0.Ricardo Wurmus
2020-03-01gnu: r-hdf5array: Update to 1.14.3.Ricardo Wurmus
2020-03-01gnu: r-rsamtools: Update to 2.2.3.Ricardo Wurmus
2020-03-01gnu: r-edger: Update to 3.28.1.Ricardo Wurmus
2020-03-01gnu: r-seurat: Update to 3.1.4.Ricardo Wurmus
2020-02-27gnu: infernal: Update to 1.1.3.Ricardo Wurmus
2020-02-27gnu: vcftools: Update to 0.1.16.Ricardo Wurmus
2020-02-27gnu: bedtools: Update to 2.29.2.Ricardo Wurmus
2020-02-27gnu: rseqc: Update to 3.0.1.Ricardo Wurmus
2020-02-26gnu: proteinortho: Update to 6.0.14.Ricardo Wurmus
2020-02-26gnu: diamond: Update to 0.9.30.Ricardo Wurmus
2020-02-26gnu: crossmap: Update to 0.3.8.Ricardo Wurmus
2020-02-26gnu: macs: Update to 2.2.6.Ricardo Wurmus
2020-02-26gnu: Remove python-loompy-for-pigx-scrnaseq.Ricardo Wurmus
2020-02-26gnu: pigx-scrnaseq: Update to 1.1.3.Ricardo Wurmus
2020-02-25gnu: jamm: Update to 1.0.7.6.Ricardo Wurmus
2020-02-19gnu: r-scran: Update to 1.14.6.Ricardo Wurmus
2020-02-19gnu: r-hdf5array: Update to 1.14.2.Ricardo Wurmus
2020-02-19gnu: r-gviz: Update to 1.30.3.Ricardo Wurmus
2020-02-19gnu: r-rhtslib: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus
2020-02-19gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.38.2.Ricardo Wurmus
2020-02-19gnu: r-rsamtools: Update to 2.2.2.Ricardo Wurmus
2020-02-19gnu: r-limma: Update to 3.42.2.Ricardo Wurmus
2020-02-19gnu: r-shortread: Update to 1.44.3.Ricardo Wurmus
2020-02-19gnu: r-seurat: Update to 3.1.3.Ricardo Wurmus
2020-02-19gnu: r-qtl: Update to 1.45-11.Ricardo Wurmus
2020-02-18gn: edirect: Update to 12.1.20190829.Efraim Flashner
2020-02-13gnu: python2-pbcore: Remove python2-sphinx dependency.Marius Bakke
2020-01-27gnu: r-gviz: Update to 1.30.1.Ricardo Wurmus
2020-01-27gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.38.1.Ricardo Wurmus
2020-01-27gnu: r-s4vectors: Update to 0.24.3.Ricardo Wurmus