summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2022-01-11gnu: stringtie: Update to 2.2.0.Ricardo Wurmus
2022-01-11gnu: Add htslib-for-stringtie.Ricardo Wurmus
2022-01-04gnu: r-archr: Update to 1.0.1-1.92ab814.Ricardo Wurmus
2021-12-30gnu: Remove trailing period from synopsis.Vagrant Cascadian
2021-12-30gnu: python-pyspoa: Fix trailing whitespace in synopsis.Vagrant Cascadian
2021-12-30gnu: lofreq: Fix trailing whitespace in synopsis.Vagrant Cascadian
2021-12-30gnu: arriba: Fix trailing whitespace in synopsis.Vagrant Cascadian
2021-12-29gnu: ivar: Fix trailing whitespace in description.Vagrant Cascadian
2021-12-20gnu: sortmerna: Update to 4.3.4.Ricardo Wurmus
2021-12-17gnu: Remove unneeded uses of custom GCC versions.Marius Bakke
2021-12-13gnu: Simplify package inputs.Ludovic Courtès
2021-12-12gnu: salmon: Update to 1.6.0.Ricardo Wurmus
2021-12-10Merge remote-tracking branch 'signed/master' into core-updatesMathieu Othacehe
2021-12-10gnu: Add ccwl.Arun Isaac
2021-12-09gnu: pplacer: Fix build.Efraim Flashner
2021-12-09gnu: python-dendropy: Skip additional test.Efraim Flashner
2021-12-09gnu: imp: Build with default cmake.Efraim Flashner
2021-12-09gnu: repeat-masker: Update to 4.1.2-p1.Ricardo Wurmus
2021-12-09gnu: metabat: Update to 2.15.Ricardo Wurmus
2021-12-09gnu: seek: Update to 1-1.196ed4c.Ricardo Wurmus
2021-12-09gnu: miso: Update to 0.5.4-1.b714021.Ricardo Wurmus
2021-12-09gnu: Add samtools-1.2.Ricardo Wurmus
2021-12-09gnu: Add htslib-for-samtools-1.2.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: tadbit: Update to 1.0.1-1.5c4c1dd.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: paml: Pass -fcommon to compiler.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: paml: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: sambamba: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: discrover: Add texlive-fonts-ec to inputs.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: discrover: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: tbsp: Update to 1.0.0-2.dc30c03.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: mantis: Update to 0.1-2.b6979a2.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: imp: Disable tests.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: snap-aligner: Update to 2.0.0.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: snap-aligner: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: snap-aligner: Run tests conditionally.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: khmer: Cythonize source files.Ricardo Wurmus
2021-12-08gnu: cwltool: Update to 3.1.20211107152837.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: newick-utils: Pass -fcommon to compiler.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: blasr: Update to 5.3.5.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: blasr: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: blasr-libcpp: Update to 5.3.5.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: htseq: Update to 0.12.3.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: clipper: Update to 2.0.1.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: pbbam: Update to 1.7.0.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: bwa-pssm: Fix build.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: Add pbcopper.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: fsom: Build with GCC 6.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: python-velocyto: Remove generated C files.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: python-schema-salad: Update to 8.2.20211116214159.Ricardo Wurmus
2021-12-07gnu: taxtastic: Update to 0.9.2.Ricardo Wurmus
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