summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2018-10-21gnu: python2-dendropy: Disable failing test.Ben Woodcroft
2018-10-20gnu: bowtie: Update to 2.3.4.3.Ricardo Wurmus
2018-10-20gnu: blast+: Use INVOKE and return #T unconditionally.Ricardo Wurmus
2018-10-20gnu: bedops: Update to 2.4.35.Ricardo Wurmus
2018-10-20gnu: bedops: Use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-10-20gnu: bamm: Fetch from git and use INVOKE.Ricardo Wurmus
2018-10-20gnu: aragorn: Use invoke and simplify.Ricardo Wurmus
2018-10-20gnu: clipper: Update to 1.2.1.Ricardo Wurmus
2018-10-20gnu: python-pybedtools: Update to 0.7.10.Ricardo Wurmus
2018-10-20gnu: Add bedtools-2.26.Ricardo Wurmus
2018-10-11gnu: kallisto: Update to 0.44.0.Ricardo Wurmus
2018-10-08gnu: Add filtlong.pimi
2018-10-05gnu: Add ngless.Ricardo Wurmus
2018-10-05gnu: bioruby: Update to 1.5.2.Christopher Baines
2018-10-05gnu: samtools-0.1: Adjust to match changes in samtools.Ricardo Wurmus
2018-10-05gnu: deeptools: Update to 3.1.2.Ricardo Wurmus
2018-10-05gnu: python-pysam: Update to 0.15.1.Ricardo Wurmus
2018-10-05gnu: bcftools: Update to 1.9.Ricardo Wurmus
2018-10-05gnu: samtools: Update to 1.9.Ricardo Wurmus
2018-10-05gnu: htslib: Update to 1.9.Ricardo Wurmus
2018-10-02gnu: Add r-absfiltergsea.pimi
2018-10-02gnu: Add poretools.pimi
2018-09-30gnu: Add porechop.pimi
2018-09-24gnu: Add r-bseqsc.Ricardo Wurmus
2018-09-24gnu: Add r-cssam.Ricardo Wurmus
2018-09-24gnu: Add r-xbioc.Ricardo Wurmus
2018-09-22gnu: hmmer: Update to 3.2.1.Ben Woodcroft
2018-09-21gnu: Add r-pore.pimi
2018-09-20gnu: rsem: Update to 1.3.1.Ricardo Wurmus
2018-09-14gnu: Add python-hic2cool.Ricardo Wurmus
2018-09-10Adjust all users of (gnu packages ldc) to use (gnu packages dlang).Leo Famulari
2018-09-10gnu: Add python-pygenometracks.Ricardo Wurmus
2018-09-10gnu: Add python-hicexplorer.Ricardo Wurmus
2018-09-10gnu: Add python-cooler.Ricardo Wurmus
2018-09-10gnu: Add python-pyfaidx.Ricardo Wurmus
2018-09-10gnu: Add python-pypairix.Ricardo Wurmus
2018-09-10gnu: Add python-intervaltree.Ricardo Wurmus
2018-09-09gnu: r-annotationhub: Update to 2.12.1.Ricardo Wurmus
2018-09-06Add missing use-modules clause.Ricardo Wurmus
2018-09-05gnu: pigx-scrnaseq: Use latest version of Pandoc.Ricardo Wurmus
2018-09-05gnu: pigx-bsseq: Use latest version of Pandoc.Ricardo Wurmus
2018-09-05gnu: pigx-chipseq: Use latest version of Pandoc.Ricardo Wurmus
2018-09-05gnu: pigx-rnaseq: Use latest version of Pandoc.Ricardo Wurmus
2018-09-05gnu: r-rcas: Use standard version of ghc-pandoc-citeproc.Ricardo Wurmus
2018-09-05gnu: r-graph: Move from bioinformatics to bioconductor.Ricardo Wurmus
2018-09-05gnu: r-scran: Update to 1.8.4.Ricardo Wurmus
2018-09-05gnu: r-scater: Update to 1.8.4.Ricardo Wurmus
2018-09-05gnu: r-hdf5array: Update to 1.8.1.Ricardo Wurmus
2018-09-05gnu: r-ggbio: Update to 1.28.5.Ricardo Wurmus
2018-09-05gnu: r-biovizbase: Update to 1.28.2.Ricardo Wurmus
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