summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2021-03-03gnu: infernal: Update to 1.1.4.Tim Howes
2021-03-03gnu: hmmer: Update to 3.3.2.Tim Howes
2021-03-02gnu: kallisto: Update to 0.46.2.Ricardo Wurmus
2021-03-02gnu: kallisto: Use older htslib.Ricardo Wurmus
2021-02-28gnu: f-seq: Use HTTPS home page URI.Nicolas Goaziou
2021-02-23gnu: Add star-for-pigx.Ricardo Wurmus
2021-02-22gnu: star: Update to 2.7.8a.Ricardo Wurmus
2021-02-19gnu: nanopolish: Fix script wrapping.Ricardo Wurmus
2021-02-19gnu: Add prinseq.Ricardo Wurmus
2021-02-19gnu: Add ngshmmalign.Ricardo Wurmus
2021-02-18gnu: Add r-archr.Ricardo Wurmus
2021-02-15gnu: Add indelfixer.Ricardo Wurmus
2021-02-11gnu: bowtie1: Update to 1.3.0.Mădălin Ionel Patrașcu
2021-02-11gnu: r-gage: Update to 2.40.1.Ricardo Wurmus
2021-02-11gnu: r-msnbase: Update to 2.16.1.Ricardo Wurmus
2021-02-11gnu: r-methylkit: Update to 1.16.1.Ricardo Wurmus
2021-02-11gnu: r-delayedarray: Update to 0.16.1.Ricardo Wurmus
2021-02-11gnu: r-biomart: Update to 2.46.3.Ricardo Wurmus
2021-02-11gnu: r-edger: Update to 3.32.1.Ricardo Wurmus
2021-02-11gnu: r-iranges: Update to 2.24.1.Ricardo Wurmus
2021-02-11gnu: r-s4vectors: Update to 0.28.1.Ricardo Wurmus
2021-02-11gnu: r-systempiper: Update to 1.24.3.Ricardo Wurmus
2021-02-11gnu: r-gseabase: Update to 1.52.1.Ricardo Wurmus
2021-02-11gnu: r-genefilter: Update to 1.72.1.Ricardo Wurmus
2021-02-05gnu: rsem: Link with shared libhts library.Ricardo Wurmus
2021-02-01gnu: vcflib: Fix generated pkg-config file.Efraim Flashner
2021-01-29gnu: grocsvs: Remove package.Maxim Cournoyer
2021-01-28gnu: Add r-demultiplex.Ricardo Wurmus
2021-01-28gnu: Add repeat-masker.Ricardo Wurmus
2021-01-28gnu: Add trf.Ricardo Wurmus
2021-01-19gnu: freebayes: Update source, home-page URIs.Efraim Flashner
2021-01-19gnu: freebayes: Don't include vcflib sources.Efraim Flashner
2021-01-19gnu: vcflib: Add pkg-config file.Efraim Flashner
2021-01-19gnu: vcflib: Build a shared library.Efraim Flashner
2021-01-19gnu: freebayes: Extend test timeout on slower architectures.Efraim Flashner
2021-01-18gnu: Add r-snapatac.Mădălin Ionel Patrașcu
2021-01-18gnu: mafft: Update to 7.475.Mădălin Ionel Patrașcu
2021-01-18gnu: ruby-bio-vcf: Rename to bio-vcf.Efraim Flashner
2021-01-18gnu: Add ruby-bio-vcf.Efraim Flashner
2021-01-17gnu: freebayes: Update to 1.3.3.Efraim Flashner
2021-01-17gnu: multichoose: Install header files.Efraim Flashner
2021-01-17gnu: filevercmp: Install header files.Efraim Flashner
2021-01-14gnu: vcflib: Update to 1.0.2.Efraim Flashner
2021-01-14gnu: sambamba Update to 0.8.0.Efraim Flashner
2021-01-14gnu: gemma: Enable tests.Efraim Flashner
2021-01-14gnu: gemma: Add Texinfo markup.Efraim Flashner
2021-01-14gnu: gemma: Update to 0.98.3.Efraim Flashner
2020-12-29gnu: r-ggbio: Move to (gnu packages bioconductor).zimoun
2020-12-29gnu: r-gqtlstats: Move to (gnu packages bioconductor).zimoun
2020-12-29gnu: r-snpstats: Move to (gnu packages bioconductor).zimoun