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2019-09-02gnu: Add rust-redox-syscall, rust-thread-id.Efraim Flashner
* gnu/packages/crates-io.scm (rust-redox-syscall, rust-thread-id): New variables.
2019-09-02gnu: r-ldblock: Update to 1.14.2.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-ldblock): Update to 1.14.2. [propagated-inputs]: Remove r-erma; add r-ensdb-hsapiens-v75, r-ensembldb, and r-httr.
2019-09-02gnu: r-mixomics: Update to 6.8.2.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioconductor.scm (r-mixomics): Update to 6.8.2.
2019-09-02gnu: r-fgsea: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioconductor.scm (r-fgsea): Update to 1.10.1.
2019-09-02gnu: r-seurat: Update to 3.1.0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-seurat): Update to 3.1.0. [propagated-inputs]: Add r-leiden, r-rcppannoy, and r-uwot.
2019-09-02gnu: r-rtracklayer: Update to 1.44.3.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-rtracklayer): Update to 1.44.3.
2019-09-02gnu: r-biomart: Update to 2.40.4.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-biomart): Update to 2.40.4.
2019-09-02gnu: r-annotationdbi: Update to 1.46.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-annotationdbi): Update to 1.46.1.
2019-09-02gnu: r-iranges: Update to 2.18.2.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-iranges): Update to 2.18.2.
2019-09-02gnu: r-pbapply: Update to 1.4-2.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/statistics.scm (r-pbapply): Update to 1.4-2.
2019-09-02gnu: r-rmarkdown: Update to 1.15.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/statistics.scm (r-rmarkdown): Update to 1.15.
2019-09-02gnu: r-hms: Update to 0.5.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/statistics.scm (r-hms): Update to 0.5.1.
2019-09-02gnu: r-whisker: Update to 0.4.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/statistics.scm (r-whisker): Update to 0.4.
2019-09-02gnu: r-chron: Update to 2.3-54.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/statistics.scm (r-chron): Update to 2.3-54.
2019-09-02gnu: Add r-leiden.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-leiden): New variable.
2019-09-02gnu: r-umap: Update to 0.2.3.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-umap): Update to 0.2.3.1. [propagated-inputs]: Add r-openssl.
2019-09-02gnu: r-enrichr: Update to 2.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-enrichr): Update to 2.1.
2019-09-02gnu: r-dalex: Update to 0.4.7.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-dalex): Update to 0.4.7.
2019-09-02gnu: r-ggforce: Update to 0.3.1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-ggforce): Update to 0.3.1.
2019-09-02gnu: r-bookdown: Update to 0.13.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-bookdown): Update to 0.13.
2019-09-02gnu: r-tdthap: Update to 1.1-11.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-tdthap): Update to 1.1-11.
2019-09-02gnu: r-units: Update to 0.6-4.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-units): Update to 0.6-4.
2019-09-02gnu: r-wgaim: Update to 2.0-0.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-wgaim): Update to 2.0-0. [propagated-inputs]: Remove r-lattice; add r-ggplot2.
2019-09-02gnu: r-apcluster: Update to 1.4.8.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-apcluster): Update to 1.4.8.
2019-09-02gnu: r-lavaan: Update to 0.6-5.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-lavaan): Update to 0.6-5.
2019-09-02gnu: r-ggextra: Update to 0.9.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-ggextra): Update to 0.9. [propagated-inputs]: Add r-r6.
2019-09-02gnu: r-fields: Update to 9.8-6.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-fields): Update to 9.8-6.
2019-09-02gnu: r-rgl: Update to 0.100.30.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-rgl): Update to 0.100.30.
2019-09-02gnu: r-afex: Update to 0.25-1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-afex): Update to 0.25-1.
2019-09-02gnu: r-summarytools: Update to 0.9.4.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-summarytools): Update to 0.9.4.
2019-09-02gnu: r-coin: Update to 1.3-1.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-coin): Update to 1.3-1.
2019-09-02gnu: r-libcoin: Update to 1.0-5.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-libcoin): Update to 1.0-5.
2019-09-02gnu: r-magick: Update to 2.2.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-magick): Update to 2.2.
2019-09-02gnu: r-raster: Update to 3.0-2.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-raster): Update to 3.0-2.
2019-09-02gnu: r-zip: Update to 2.0.4.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-zip): Update to 2.0.4.
2019-09-02gnu: r-arules: Update to 1.6-4.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-arules): Update to 1.6-4.
2019-09-02gnu: r-radiant-data: Update to 1.0.6.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-radiant-data): Update to 1.0.6.
2019-09-02gnu: r-xfun: Update to 0.9.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-xfun): Update to 0.9.
2019-09-02gnu: r-seriation: Update to 1.2-8.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-seriation): Update to 1.2-8.
2019-09-02gnu: r-dtw: Update to 1.21-3.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-dtw): Update to 1.21-3.
2019-09-02gnu: r-geometry: Update to 0.4.3.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-geometry): Update to 0.4.3.
2019-09-02gnu: r-circlize: Update to 0.4.7.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-circlize): Update to 0.4.7.
2019-09-02gnu: r-pkgbuild: Update to 1.0.5.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-pkgbuild): Update to 1.0.5.
2019-09-02gnu: r-rgooglemaps: Update to 1.4.4.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-rgooglemaps): Update to 1.4.4.
2019-09-02gnu: r-d3r: Update to 0.8.7.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-d3r): Update to 0.8.7.
2019-09-02gnu: r-vegan: Update to 2.5-6.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-vegan): Update to 2.5-6.
2019-09-02gnu: r-sys: Update to 3.3.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/cran.scm (r-sys): Update to 3.3.
2019-09-02gnu: Add r-ensdb-hsapiens-v75.Ricardo Wurmus
* gnu/packages/bioconductor.scm (r-ensdb-hsapiens-v75): New variable.
2019-09-02gnu: vim-fugitive: Update to 3.0.Efraim Flashner
* gnu/packages/vim.scm (vim-fugitive): Update to 3.0. [arguments]: Install syntax directory.
2019-09-02gnu: emacs-lsp-mode: Update to 6.1.Brian Leung
* gnu/packages/emacs-xyz.scm (emacs-lsp-mode): Update to 6.1. [inputs]: Add emacs-markdown-mode. Signed-off-by: Efraim Flashner <efraim@flashner.co.il>