summary refs log tree commit diff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2020-05-19gnu: sra-tools: Update to 2.10.6.Ricardo Wurmus
2020-05-19gnu: ncbi-vdb: Update to 2.10.6.Ricardo Wurmus
2020-05-19gnu: ngs-sdk: Update to 2.10.5.Ricardo Wurmus
2020-05-05Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-05-05gnu: Add grocsvs.Efraim Flashner
2020-04-30Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-04-30gnu: Add miniasm.Roel Janssen
2020-04-30gnu: python2-warpedlmm: Fix build.Ricardo Wurmus
2020-04-28gnu: Add variant-tools.Ricardo Wurmus
2020-04-28gnu: r-hdf5array: Update to 1.14.4.Ricardo Wurmus
2020-04-28gnu: r-seurat: Update to 3.1.5.Ricardo Wurmus
2020-04-27gnu: Update minimap2 to 2.17.Roel Janssen
2020-04-27gnu: Add python-deeptools.Roel Janssen
2020-04-27gnu: Add python-deeptoolsintervals.Roel Janssen
2020-04-26gnu: python-scanpy: Update to 1.4.6.Efraim Flashner
2020-04-19Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-04-17gnu: python-pygenometracks: Update to 3.3.Ricardo Wurmus
2020-04-17gnu: Add python-hicmatrix.Ricardo Wurmus
2020-04-17gnu: python-cooler: Update to 0.8.7.Ricardo Wurmus
2020-04-17gnu: python-pybigwig: Update to 0.3.17.Ricardo Wurmus
2020-04-15Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-04-14gnu: r-delayedarray: Update to 0.12.3.Ricardo Wurmus
2020-04-14gnu: r-s4vectors: Update to 0.24.4.Ricardo Wurmus
2020-04-14gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.42.Ricardo Wurmus
2020-04-13Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-04-12gnu: r-bamsignals: Fix grammar of "allows to efficiently obtain" toVagrant Cascadian
2020-04-12gnu: r-qtl: Fix grammar "allows to estimate" to "estimates".Vagrant Cascadian
2020-04-11Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-04-09gnu: minimap2: Fix cond expression for Guile 3 compatibility.Marius Bakke
2020-04-08Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-04-05gnu: python-intervaltree: Update to 3.0.2.Jakub Kądziołka
2020-04-03gnu: sailfish: Fix build failure.Marius Bakke
2020-04-01gnu: r-biomart: Update to 2.42.1.Ricardo Wurmus
2020-04-01gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.22.1.Ricardo Wurmus
2020-03-27Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-03-26gnu: Update sambamba to 0.7.1.Roel Janssen
2020-03-24gnu: r-tximport: Update to 1.14.2.Ricardo Wurmus
2020-03-22gnu: edirect: Install more programs.Efraim Flashner
2020-03-22gnu: Add edirect-go-programs.Efraim Flashner
2020-03-18Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-03-14Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke
2020-03-17gnu: pigx-scrnaseq: Update to 1.1.4.Ricardo Wurmus
2020-03-16gnu: star: Update to 2.7.3a.Ricardo Wurmus
2020-03-13gnu: salmon: Adjust for C_INCLUDE_PATH changes.Marius Bakke
2020-03-12gnu: edirect: Update to 13.3.20200128.Efraim Flashner
2020-03-12gnu: r-qtl: Update to 1.46-2.Ricardo Wurmus
2020-03-11gnu: python-pybedtools: Update to 0.8.1.Efraim Flashner
2020-03-11gnu: python-pyfaidx: Update to 0.5.8.Efraim Flashner
2020-03-11gnu: Add python2-pyfaidx.Efraim Flashner
2020-03-10gnu: java-forester-1.005: Update source URI.Björn Höfling